De microscoop PCE-IDM 3D is uitgerust met een eigen bedienersinterface, waarbij verscheidene analysefuncties ter beschikking staan. De livebeelden en de data van de bedienersinterface worden samen via de VGA aansluiting overgedragen naar een aangesloten monitor. Voor de bediening van de bedienersinterface kan gebruik gemaakt van een standaard pc-muis, welke ook meegeleverd wordt. Naast de VGA-aansluiting, kan ook gekozen worden voor het gebruiken van een de usb-interface om de beelden rechtstreeks over te dragen naar de pc. De 3D digitale microscoop wordt door de pc herkent als webcam. Hierdoor wordt een livestream video overdracht mogelijk. 

Met behulp van het focusbereik van 250 mm en de platformgrootte van 305x225 mm kunnen ook grotere objecten onderzocht worden met de 3D microscoop. Aanvullend beschikt de microscoop over een rondom traploze belichting. Dankzij deze belichting wordt het object altijd voldoende belicht. Het design van de digitale microscoop maakt een snelle op- en afbouw mogelijk, waardoor de microscoop ook mobiel inzetbaar is.